ニワトリ網膜の細胞アトラスのPreprintをbioRxivに上げました。
CELL ATLAS OF THE CHICK RETINA:
SINGLE CELL PROFILING IDENTIFIES 136 CELL TYPES
Masahito Yamagata, Wenjun Yan, Joshua R. Sanes
https://doi.org/10.1101/2020.10.09.333633
網膜の構造と機能は多くの脊椎動物で研究されてきたが、分子的特徴付けは主に哺乳類に限られていた。我々は、単細胞RNAシークエンス(scRNA-seq)を用いて、ニワトリ網膜の細胞アトラスを作成しました。約40,000個の単細胞トランスクリプトームから、脊椎動物に保存されている6つのクラス(光受容体、水平細胞、双極細胞、アマクリン細胞、網膜神経節、グリア細胞)に分類される136種類の細胞を同定しました。分子プロファイルと形態を一致させるために、我々はCRISPRを基盤としたレポーターを選択的に発現する遺伝子にインテグレートする方法を利用した。ミュラーグリアについては、転写的に異なる細胞が網膜の前後軸、背側-背側、中央-末梢軸に沿って領域的に局在していることを発見した。また、未熟な光受容体、水平細胞、オリゴデンドロサイトのタイプを同定し、胚発生後期にまで持続することを明らかにした。最後に、ニワトリ、マウス、霊長類の網膜細胞のクラスとタイプの関係を解析した。これらの結果は、鳥類の視覚系の解剖学的、生理学的、進化学的、発生学的研究の基礎を提供するものである。
(DeepLによるサマリーの日本語訳)