私事ですが、今年いっぱいで日本に帰国することになりました。結局、研究を続けることができるポストが見つからなかったので、「無職」での帰国です。ハーバード大学との関係はアソシエートとして維持しますので、ハーバード大学関係者として公式に活動することは可能です。
新型コロナウイルス感染症は、冬季になった米国では爆発的に広がっていて、毎日2000人以上の死者がでており、これから数週間すると毎日4000人に達するのではないか、という予測もでています。ボストンは米国の中でも比較的落ち着いている地域なのですが、それでも日々増加していて、春のロックダウン以来、大学の事務などが動いていないなど様々な制約が続いています。大学での研究も建物内にほとんど人がおらず、ウェットな研究は事実上稼働していない状況です。また、現在いるラボのPI（Center for Brain Science, Harvard Universityのディレクター）が2020年夏にRetirementをし、2021年中にはラボも閉鎖になるということで、メンバーが少なくなっていき、ラボ全体が動いていないということもあります（例えば、大腸菌プレートを自分で作っている）。というわけで、ウェットな研究はもはや集中して仕事ができないこと、更にこの12月末にビザ（O1）の期限が切れることをきっかけに、年内をもって日本に帰国することにしました。
研究内容を知っていただくために、オンラインセミナーをさせていただけるような機会も求めます（ご相談ください）。言語は、日本語でも英語でもどちらでもやります。
内容は、網膜を中心にした神経回路形成の話題です。一つのストーリーをもった内容とするため、以下の論文の内容を中心に、scRNAseq、ゲノム編集、構造生物学、合成生物学、光遺伝学などの話題が含まれる予定ですが、こういうことを特に詳しくということがあれば、それについても対応します。
(プレプリント) Yamagata, M., Yan, W., Sanes, J.R. (2020).
Cell atlas of the chick retina: single-cell profiling identifies 136 cell types.
bioRxiv 2020.10.09.333633 doi: 10.1101/2020.10.09.333633
(総説）Yamagata, M. (2020).
Structure and Functions of Sidekicks.
Front. Mol. Neurosci. 13, 139.doi: 10.3389/fnmol.2020.00139 (PMID: 32982686)
内容は、上の２つの論文やそこから引用された私の論文をみるとわかると思います。
Yamagata, M., Sanes, J. R. (2019).
Expression and roles of the immunoglobulin superfamily recognition molecule sidekick1 in mouse retina.
Front. Mol. Neurosci. 11, 485.doi: 10.3389/fnmol.2018.00485 (PMID: 30687002)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (2018).
Reporter-nanobody fusions (RANbodies) as versatile, small, sensitive immunohistochemical reagents.
Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 115, 2126-2131. doi: 10.1073/pnas.1722491115 (PMID: 29440485)
*Goodman, K.M., *Yamagata, M., Jin, X., Mannepalli, S., Katsamba, P.S., Ahlsén, G., Sergeeva, A.P., Honig, B., Sanes, J.R., Shapiro, L. (2016).
Molecular basis of sidekick-mediated cell-cell adhesion and specificity.
eLife 5, e19058 (*1st Coauthor) doi: 10.7554/eLife.19058 (PMID: 27644106)
*Krishnaswamy, A., *Yamagata, M., Duan, X., Hong, Y.K., Sanes, J.R. (2015).
Sidekick 2 directs formation of a retinal circuit that detects differential motion.
Nature 524, 466–470. (*1st Coauthor) doi: 10.1038/nature14682 (PMID: 26287463)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (2012).
Expanding the Ig superfamily code for laminar specificity in retina: expression and role of contactins.
J. Neurosci. 32, 14402-14414. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3193-12.2012 (PMID: 23055510)
Yamagata M, Sanes JR. (2010).
Synaptic localization and function of Sidekick recognition molecules require MAGI scaffolding proteins.
J. Neurosci. 30, 3579-3588. doi: 10.1523/JNEUROSCI.6319-09.2010 (PMID: 20219992)
Kim, I.J., Zhang, Y., Yamagata, M., Meister, M., Sanes, J.R. (2008).
Molecular identification of a retinal cell type that responds to upward motion.
Nature 452, 478-482. doi: 10.1038/nature06739 (PMID: 18368118)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (2008).
Dscam and Sidekick proteins direct lamina-specific synaptic connections in vertebrate retina.
Nature 451, 465-469.doi: 10.1038/nature06469 (PMID: 18216854)
Yamagata, M., Weiner, J.A., Dulac, C., Roth, K.A., Sanes, J.R. (2006).
Labeled lines in the retinotectal system: Markers for retinorecipient sublaminae and the retinal ganglion cell subsets that innervate them.
Mol Cell Neurosci. 33, 296-310.doi: 10.1016/j.mcn.2006.08.001 (PMID: 16978878)
Yamagata, M., Weiner, J.A., Sanes, J.R. (2002).
Sidekicks: synaptic adhesion molecules that promote lamina-specific connectivity in the retina.
Cell 110, 649-660. doi: 10.1016/s0092-8674(02)00910-8 (PMID: 12230981)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (1995).
Target-independent diversification and target specific projections of chemically coded retinal ganglion cell.
Development. 121, 3763-3776. (PMID: 8582286)
Yamagata, M., Herman, J.-P., Sanes, J.R. (1995).
Lamina-specific expression of adhesion molecules in developing chick optic tectum.
J. Neurosci. 15, 4556-4571.
doi: 10.1523/JNEUROSCI.15-06-04556.1995 (PMID: 7790923)
Yamagata, M. and Sanes, J. R. (1995).
Lamina-specific outgrowth and arborization of retinal axons in chick optic tectum.
Development 121, 189-200. (PMID: 7867499)
